区卫生局是区政府主管全区卫生工作的职能部门。其主要职能是：

1、贯彻执行党和国家有关卫生工作的方针政策、法规政令，结合实际拟订全区卫生管理工作规定和实施办法。

2、负责拟订全区卫生事业改革与发展的总体方案和中、长期发展规划、年度计划，并组织实施。

3、负责卫生系统思想政治工作，职业道德和法纪教育，纠正行业不正之风，组织医学、卫生专业教育和在职人员再教育。

4、负责卫生技术人才的培养、调配和医、防、保专业技术建设，组织科研与教学、收集交流医疗卫生科学技术信息。

5、负责草拟全区实现“人人享有卫生保健”目标的总体规划和具体实施办法。

6、负责妇女、儿童保健，防治危害妇女、儿童健康的疾病。

7、制定全区疾病防治规划并组织实施，负责防治和消灭各种传染病，协助有关部门防治职业病。

8、贯彻执行公共卫生法律法规，开展卫生监督与管理。

9、负责制定我区区域卫生发展规划，建设辖区二级医疗防治网，指导医疗卫生单位的业务建设，负责医院分级管理的实施、评审。根据管理权限负责审批和管理社会医疗机构（单位），负责全区医疗卫生技术和质量的控制与管理。

10、负责全区中医药行业的管理，发展中医药事业。11、负责辖区医疗急救网的规划、建设，组织指挥突发事故的医疗救护，配合市三级医疗网，完成国内外医疗卫生救助任务。

12、负责卫生事业经费的申报和计划管理，组织审计监督。制定和审批防治设施及设备计划，合理分配卫生资源。

13、根据深圳市医疗卫生收费统一标准，审核区属医疗卫生机构收费项目，并监督执行。

14、负责区属医疗卫生机构专业技术人员的专业技术职称评聘的考核、审查、申报和聘任管理。

15、协同有关部门开展卫生进社区工作和爱国卫生运动，加强卫生宣传教育，建设卫生城市。

16、协助有关部门组织安排招生、招工、调干、兵役和出国人员的体检检查。

17、负责全区干部的体检和日常保健服务工作。

18、领导和管理盐田区医学会等学术团体，协调红十字会的工作。

19、负责全系统610工作，做好“法轮功”练习者的思想转化工作。

20、负责抓好全系统的安全生产工作，督促检查各院站安全责任制的落实。

21、负责全系统的党风廉政建设，抓好党的建设、班子建设、党员队伍建设，创建“好班子”活动。加强与各民主党派的沟通、协商，共商卫生事业发展大计。

22、负责做好全系统的工会组织建设工作、共青团组织建设和维护妇女的合法权益工作。

23、承办区委、区政府和上级业务部门交办的其他有关事项。